Una Passivhaus richiede la corretta progettazione della ventilazione meccanica controllata.
Attraverso questo sistema viene prelevata l'aria dalle zone in cui è esausta ed espulsa all'esterno ed immessa aria esterna di rinnovo. Il necessario ricambio d'aria viene garantito da un ventilatore regolabile, per mezzo del quale si regola il tasso di ricambio d'aria e che può essere dotato di scambiatore di calore per il recupero del calore.
Nei locali viene immessa esclusivamente aria fresca, senza che mai abbia luogo miscelazione con aria esausta.
I vantaggi di questo sistema vanno dal rinnovo d'aria costante, anche nelle ore notturne, alla garanzia di un ricambio d'aria igienico costante, dal raggiungimento dell’umidità ambientale ottimale alla possibilità, mediante l'impiego di filtri appositi, di depurare l'aria da polveri, pollini ed altri allergeni.
Questo meccanismo di ventilazione unisce dunque risparmio energetico e salute ambientale.